Полевое управление 40-й армии было развёрнуто в Туркестанском военном округе. В течение последующих трех недель были сформированы основные части и соединения армии.
А 24 декабря 1979 года министр обороны СССР Д. Ф. Устинов провёл совещание с руководящим составом Министерства обороны, где объявил о принятом решении ввести войска в Афганистан. Так началась афганская эпопея, в которой военнослужащим 40-й армии было суждено сыграть ключевую роль.